dr. Koczor Ádám
növényorvos
Fokhagyma vírusos betegségei
A doktori kutatásom a fokhagyma (Allium sativum) előforduló vírusok molekuláris szintű elemzésére irányult, különös tekintettel a Potyvirus, Carlavirus és Allexivirus nemzetségek fajaira. Magyarországon eddig kevés kutatás foglalkozott e vírusokkal, noha ezek súlyosan érinthetik a terméshozamot. Kutatásom célja a hazánkban fellelhető vírusfajok azonosítása és a kevert fertőzések hatásának felmérése volt.
Elsőként nukleinsav-kivonással és reverz transzkripciós PCR-rel (RT-PCR) dolgoztam, amelyekkel sikeresen kimutattam több vírus jelenlétét különböző fokhagyma-mintákban. Az alkalmazott primerkészletek között saját fejlesztésű és szakirodalmi források alapján optimalizált primereket használtam. A primerkészletek segítségével például egy, a hazai mintákból izolált Leek yellow stripe virus (LYSV) genetikai profilját is feltérképeztem. Ez az izolátum jelentős genetikai hasonlóságot mutatott a globális adatbázisban lévő ázsiai és európai LYSV izolátumokkal, ami arra utal, hogy a vírus az importált szaporítóanyagok révén is terjedhet.
A kevert fertőzéseket illetően a Potyvirus és Carlavirus nemzetségek együttes jelenlétét is azonosítottam, amelyek szinergikusan rontják a növények állapotát, ezáltal akár 20-30%-kal is csökkentve a terméshozamot. A PCR és szekvenciaanalízis eredményei alapján a magyar fokhagymamintákban azonosított Shallot latent virus (SLV) és Garlic virus B (GarV-B) törzsek különösen veszélyesnek bizonyultak, mert a kevert fertőzések kialakulásában aktívan részt vesznek, így fokozva a betegség súlyosságát.
A kutatás végén filogenetikai elemzést végeztem, hogy megértsem a hazai vírusok és a nemzetközi izolátumok közötti kapcsolatokat. A törzsfákon megfigyelt genetikai közelségek alapján arra következtettem, hogy a vizsgált vírusok közül több származhat az ázsiai és európai kereskedelmi fokhagyma-ültetvényekről. Ez az eredmény megerősíti azt az elméletet, hogy az importált szaporítóanyaggal könnyen behurcolhatók hazánkba a fertőzések, ezért kiemelten fontos a hazai szaporítóanyagok rendszeres vírusellenőrzése.
Eredményeim alapján javasoltam egy komplex növényvédelmi protokoll kidolgozását, amely kombinálná a vírusmentes szaporítóanyag használatát és a kevert fertőzések kimutatására alkalmas, célzott diagnosztikai eljárásokat. Úgy vélem, hogy kutatásom hozzájárulhat a magyar fokhagymatermesztés versenyképességéhez és a vírusos betegségek elleni védekezés hatékonyságának növeléséhez.
Ha van gondolatod a témában, vedd fel velem a kapcsolatot.
A témában megjelent írásaim
Képek
Leírás
A doktori kutatásom a fokhagyma (Allium sativum) vírusainak molekuláris szintű elemzésére irányult. Magyarországon eddig kevesen foglalkoztak ezekkel a vírusokkal.